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Thema der Gewässerökologie sind Fische und der Lebensraum Fließgewässer.
Hochwasserschutz und Nutzung von Wasserkraft haben unsere Flüsse auf langen Strecken erheblich verändert.  Mit dem Ziel, den ökologischen Zustand der Gewässer in Österreich zu verbessern, werden die Gewässer überwacht, Konzepte zur Bewirtschaftung erarbeitet und Sachverständige bei wasserrechtlichen Verfahren beigezogen.

Die österreichischen Seen sind einer vielfältigen, menschlichen Nutzung ausgesetzt, die zu einer Veränderung der Wassergüte, aber auch der Fischartengemeinschaften führte.

Ohne Forschung und Wissenstransfer in die Praxis kann es keinen Fortschritt in der Aquakultur geben. Unsere Aufgaben sind die auf österreichische Belange zugeschnittene praxisrelevante Aquakulturforschung, die Übermittlung von praxisrelevanten Forschungsdaten an Erzeugerbetriebe und die Beratung und Ausbildung. Die Fischzuchtanstalt Kreuzstein befasst sich mit der Aufzucht verschiedener Fischarten vom Ei bis zur Setzlingsgröße und mit der Aquakulturforschung.

Die Ökologische Station Waldviertel war das jüngste Institut im Bundesamt für Wasserwirtschaft und ist nun die jüngste Abteilung des Institutes für Gewässerökologie und Fischereiwirtschaft. Der Schwerpunkt unserer Tätigkeit liegt im Bereich der Aquakultur in Karpfenteichen und in Warmwasser-Kreislaufanlagen sowie im Bereich der EU-Wasserrahmenrichtlinie. Standort: Gebharts 33 in 3943 Schrems

Unsere Ausbildungen werden im Sinne einer kompetenzorientierten Erwachsenenbildung durchgeführt. Unser Bildungsprogramm fördert den sorgsamen und nachhaltigen Umgang mit natürlichen Ressourcen. Die Teilnehmerinnen/Teilnehmer werden zu kompetenten Fachkräften mit eigenverantwortlichem Handeln ausgebildet. Wir sind ein Team, in dem Flexibilität, Freundlichkeit und Humor eine wichtige Rolle spielen.